למדנו בכיתה שבאלקטרופורזה עובי הבנד תלוי במספר המקטעים בבנד בלבד ללא תלות באורך המקטעים בכל בנד. השאלה שלי היא איך זה יתכן, שהרי בבנד שבו שרשרת דנ"א ארוכה יותר יש יותר נוקלאוטידים ולכן הוא אמור לתפוס יותר אטידיום ברומיד ולזהור יותר מאשר בנד שבו שרשרת קצרה.
לדוגמה אם בבנד מסוים יש שרשרת של 5000 נוקלאוטידים ובבנד אחר שרשרת של 1000 נוקלאוטידים, ומשתיהן יש מיליון עותקים, אז בבנד שבו שרשראות של 5000 יהיו פי חמש נוקלאוטידים מאשר בבנד שבו 1000, ולכן אמור להקשר פי חמש אטידיום ברומיד. מסיבה זו הייתי מצפה לראות בנד יותר זוהר, אך זה סותר את מה שלמדנו- שלאורך המקטעים אין השפעה על עובי הבנד, זוהר הבנד.
אשמח מאוד לפתרון לבעיה,
תודה רבה, פלג אופק.