כידוע, חומצה אמינית מאופיינת מחברותיה לפי המבנה הייחודי של שרשרת הצד. כידוע לי, בשעת התקפלות החלבונים, לשרשרת הצד של החומצה האמינית יש אפשרות לשנות "פוזה" במה שמכונה 'רוטמרים'. יוצא שאז המבנה של החומצה האמינית משתנה מבחינת הזויות [החומצה האמינית מתקפלת….].
רציתי לברר האם לחומצה אמינית בדידה, יש מבנה מרחבי קבוע? למשל: בתוכנת ה'פיימול' כשאתה מוריד חומצה אמינית כגון אלנין או פרולין וכדומה, מתקבל לפניך מבנה תלת ממדי מרחבי מסויים [מבחינת המרחקים והזויות של האטומים]. האם זהו המבנה המרחבי הקבוע של החומצה האמינית הבדידה?
שאלה נוספת –מדוע המבנה הנפוץ
של מולקולות הוא בצורת משושים ומחומשים?
תודה!