"המועדון המדעי" של הארגון הינו בין פעילויות החינוך הותיקות של "בשער", במסגרתו נערכים מפגשים בין אנשי אקדמיה לבין קהלים שונים במערכת החינוך: תלמידים, מורים וחניכי

(במסגרת שבוע מודעות המוח הבינלאומי) בשיתוף פעולה עם "העמותה הישראלית למדעי המוח", נערכים במהלך חודש מרץ מפגשים של חוקרים מובילים בחקר המוח עם בני נוער

במסגרת שיתוף הפעולה בין "בשער" לבין ההסתדרות הרפואית בישראל (הר"י) מתקיים השנה, בפעם הארבע עשרה, "חודש הבריאות". במסגרת פרויקט זה יוצאים רופאים מתנדבים מתחומי הרפואה השונים למקומות ישוב ברחבי

ארגון "בשער" מקיים קשר קבוע ומתמשך עם העוסקים בתחום הכשרת המורים והכנסים למורים בישראל. עד היום נפגשו המדענים המתנדבים חברי "בשער" עם למעלה מ-45,000 מורים, דוגמת